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product2026/10/18

2026 年免費文獻管理軟體怎麼選？免費工具與付費備選

比較 Zotero、Mendeley、JabRef、BibDesk 等 8 款文獻管理工具，區分長期免費、雲端額度、限時試用與機構授權，並按 Word、LaTeX 和 AI 需求給出選擇建議。

需要通用的免費文獻管理軟體，可以先試 Zotero；重視免費雲端附件空間，可以比較 Mendeley；以 LaTeX 寫作為主，可以先看 JabRef，Mac 使用者也可考慮 BibDesk。

選擇免費文獻管理軟體（free reference manager），先分清自己要的是長期儲存論文的文獻庫、在 Word 中維護引用的工具，還是只為一篇課程論文生成參考文獻表。

這三種需求，未必需要同樣的軟體。更重要的是，免費軟體、免費雲端額度、限時試用和學校付費提供的使用權限，是四種不同的成本結構。

下面比較八款常見工具：Zotero、Mendeley、JabRef、BibDesk、Paperpile、EndNote、EndNote Fusion 和 Citavi。其中前四款提供長期免費方案，其餘四款作為訂閱、付費許可或機構授權的備選。

關於本文

本文由 BibGenie 團隊撰寫，BibGenie 是我們開發的 Zotero AI 外掛。比較依據為官方產品資料，側重免費範圍、平臺、寫作整合、資料匯出與 AI 功能，未進行統一環境下的效能實測。

先看結論：八款工具與各自的免費邊界

工具免費或授權方式主要使用平臺適合的場景
Zotero核心軟體免費；官方附件同步免費 300 MBWindows、macOS、Linux，另有 Web 存取長期文獻庫、PDF 閱讀與多種寫作工具配合
Mendeley免費方案含 2 GB 個人儲存空間；更多儲存與 AI 權益按方案區分桌面客戶端與 Web已有 Mendeley 工作流、需要較多免費附件同步空間
JabRef免費開源；外部服務可能另計費Windows、macOS、LinuxBibTeX / BibLaTeX 文獻庫與 LaTeX 寫作
BibDesk免費開源macOSMac 上的 BibTeX 資料和附件管理
Paperpile30 天免費試用，之後訂閱瀏覽器、移動應用及寫作整合Google Docs 或以瀏覽器為主的工作流
EndNote個人許可或機構授權Windows、macOS 與相應 Web 功能團隊統一使用、機構培訓充分
EndNote Fusion（原 RefWorks）主要透過機構訂閱存取瀏覽器及配套寫作工具學校已採購、需要圖書館支援
Citavi付費或機構授權；提供試用Desktop / Web結合文獻、知識條目與寫作大綱組織研究

官方資料入口：Zotero 下載、Mendeley 下載、JabRef、BibDesk、Paperpile、EndNote、EndNote Fusion、Citavi。AI 功能與使用條件見後文的專項對比表。

免費開源方案：Zotero、JabRef 和 BibDesk

1. Zotero：從收集、閱讀到引用的通用起點

Zotero 適合希望建立長期文獻庫，並把網頁收集、PDF 閱讀和論文引用連起來的人。它的使用路線可以很簡單：儲存一篇文獻，檢查元資料，在文件中插入引用，然後逐步增加分類、標籤和筆記。

對新手，建議先不裝第三方外掛。先確認原生流程夠不夠用，再為翻譯、AI、筆記同步或 LaTeX 增加工具。否則，一次加入太多外掛，遇到問題時反而難以判斷來源。

核心軟體免費，官方附件同步按雲端儲存空間區分方案。 免費額度為 300 MB；付費檔為 2 GB 每年 20 美元、6 GB 每年 60 美元、無限空間每年 120 美元。本地 PDF 容量取決於電腦的磁碟空間，不受雲端額度限制。Zotero Storage

適合先選它的人：還沒有既定軟體，準備長期積累資料，並希望以後根據任務擴充套件研究環境。安裝後要優先建立備份和同步習慣，再考慮複雜的自動化。

2. JabRef：圍繞 BibTeX / BibLaTeX 管理文獻

JabRef 是免費開源的跨平臺工具，使用文字形式的書目資料，適合希望直接維護 BibTeX / BibLaTeX 庫的研究者。對於以 .bib 檔案為核心的 LaTeX 專案，檔案可讀、可帶走，是一個實用特點。JabRef 官方介紹

如果主要任務是組織 .bib 檔案，可以優先試 JabRef；如果還需要連線網頁收集、PDF 閱讀、筆記和多種寫作環境，可以同時比較 Zotero。

JabRef 從第 6 版起提供論文摘要與對話功能，使用時需配置模型服務。模型費用和資料處理方式取決於所選服務，與軟體本身的免費許可分開計算。JabRef AI 文件

3. BibDesk：Mac 上的 BibTeX 文獻管理選擇

BibDesk 是面向 macOS 的免費開源書目管理工具，可管理書目資訊、相關檔案和連結，尤其適合 LaTeX 使用者。BibDesk 官方介紹

如果你長期在 Mac 上寫 LaTeX，希望用原生桌面工具維護書目，BibDesk 值得試用。

如果主要使用 Word，或需要與不同系統上的合作者共同維護引用，應先測試相應的寫作與協作流程，再決定是否遷入整個文獻庫。

有免費方案的 Mendeley：先看儲存，再看當前客戶端

4. Mendeley：免費雲端額度更寬裕，但權益要分開看

免費方案提供 2 GB 個人儲存空間。官方定價頁列有 5 次 Reading Assistant 提問，具體可用資格與剩餘額度以帳戶當前顯示為準，不應理解為每月自動恢復的額度。更多 AI 能力按付費方案區分。Mendeley 當前方案

2 GB 指個人儲存空間，不是群組共享空間。 Mendeley 對群組儲存另設限制，升級個人儲存也不會增加共享空間。團隊使用前應單獨核對當前群組限制。免費帳戶與共享空間說明

如果你需要在多臺裝置之間讀取相同 PDF，又暫時不想購買附件同步空間，這個免費起點有實際吸引力。與其僅憑“開源還是商業”決定，不如先比較你自己的文獻量、檔案體積、帳戶條件和團隊環境。

需要留意的是，網上很多經驗來自舊版 Mendeley Desktop。當前 Reference Manager 與 Word 中的 Mendeley Cite 是另外的產品組成，教程、外掛相容性和匯出方式需要對應版本。Mendeley 官方在 2025 年表示，舊 Desktop 繼續接受必要維護，但不再開發新功能。官方維護說明

免費額度、Word 引用相容性與遷移步驟詳見 Zotero vs Mendeley。

付費備選：訂閱、個人許可與機構授權

5. Paperpile：適合優先考慮瀏覽器與 Google Docs 的人

Paperpile 適合主要在瀏覽器中收集資料、使用 Google Docs 寫作的研究者，也提供 Word、移動應用和 BibTeX 相關整合。

它提供 30 天免費試用，之後需要訂閱。學術優惠價中，Regular 折算為每月 4.15 美元，Expert 折算為每月 5.75 美元，均按年計費。購買前請確認學術資格、稅費和所需功能。Paperpile 官方定價

試用期裡，最好驗證“收集十篇真實文獻 → 整理 → 插入文件引用 → 與合作者修改”的全流程，而不是只看介面是否順眼。

6. EndNote：已有機構許可與團隊流程時很有競爭力

EndNote 的優勢需要放到實際組織環境中看。如果課題組一直使用它，學校提供許可、培訓和支援，你可能不用獨自排查每一個引用問題。

對於新購、升級與機構存取，成本結構並不相同。EndNote 官方文件也區分不同的機構許可模式，因此應問清學校提供的產品版本、後續升級和離校後的使用條件。EndNote 許可說明

學校授權可以減少個人支出，但可用期限與權益取決於機構合同。如果已有一篇使用 EndNote 的長論文，還應把轉換引用的時間計入遷移成本。

價格與遷移的詳細討論見 EndNote vs Zotero。

7. EndNote Fusion（原 RefWorks）：先確認學校當前提供的服務

EndNote Fusion（原 RefWorks）主要透過機構訂閱提供存取。它是 RefWorks 更名後的服務，並非 EndNote 桌面版。使用前請向學校圖書館確認當前服務入口、授權範圍，以及與 EndNote 桌面版之間的資料相容方式。官方更名說明

如果圖書館已經把教學、資料庫匯入和寫作支援放在 EndNote Fusion 上，它就值得測試。你獲得的不只是一個帳號，還可能有校內課程、使用指南和專門的求助渠道。

長期使用前，還應確認離校後的帳戶保留政策、附件空間、匯出方式和支援的寫作工具，並為重要資料保留獨立備份。

8. Citavi：文獻整理與知識組織需要放在一起時

Citavi 將書目管理與知識條目、大綱和寫作組織結合，適合希望在閱讀階段就把摘錄與論證結構連起來的人。官方介紹的 AI 功能包括論文要點、段落摘要與論文檢索，許可分為個人與機構等方案。Citavi 官方產品說明

Citavi 提供試用，具體期限與功能範圍以所選版本和許可為準。選擇 Desktop 或 Web 版本時，還需確認系統支援與寫作整合。

如果你的困難是“讀過很多資料，卻很難組織成章節”，這種路線值得試；若你只想快速插入引用，可能不必一開始就採用更復雜的知識組織方式。

哪款適合哪類研究者？

本科生與課程論文：先學會完整引用，不急著建立複雜系統

需要持續管理文獻時，可以先試 Zotero 或 Mendeley 的基礎流程。若只是一次性生成少量參考文獻，也可以使用免費的 ZoteroBib。

ZoteroBib 適合生成書目列表；如果後續還要在正文中反覆增刪引用、更新編號與參考文獻表，應選擇帶寫作整合的文獻管理工具。

碩博研究與長期綜述：把資料出口和團隊流程放在前面

你需要儲存的通常不只是 PDF，還有分類、批註、筆記和與稿件的關聯。因此，選擇時先用一小批真實資料驗證匯入、匯出、備份與恢復，再考慮大規模遷入。

可分別測試 Zotero、Mendeley，以及學校提供的 EndNote、EndNote Fusion 或 Citavi。對於系統綜述，還應根據專案要求配置檢索記錄、篩選決策與資料提取流程；文獻管理軟體本身不自動構成一套完整的綜述審計記錄。

LaTeX / Markdown 寫作：檢查引用鍵、匯出與檔案可維護性

先比較 JabRef、BibDesk，以及配合相應擴充套件的 Zotero。重點檢查引用鍵是否穩定、修改後如何更新，以及多人共同維護 .bib 檔案時怎麼處理衝突。

Zotero 的 Better BibTeX 等擴充套件入口，見 Zotero 外掛推薦。你不需要因為使用 LaTeX，就放棄現有的閱讀與筆記習慣；關鍵是兩部分之間的更新方式是否清楚。

醫學及格式要求嚴格的學科：拿目標期刊樣稿測試

先用實際期刊樣式，測試多作者、期刊縮寫、DOI、文章編號和不同文獻型別；同時檢查合作者的編輯環境。學校若能提供某款工具的專門支援，也應計入選擇。

最終格式取決於條目資料、所用樣式與期刊要求。選擇工具時，應同時考慮格式輸出和團隊支援。

從付費工具遷到免費工具：先看你要帶走什麼

免費軟體可以減少後續許可支出，但搬家有一次性的工作量：文獻記錄、附件、分類、筆記與 Word 欄位可能走不同的轉換路徑。

如果你已決定轉到 Zotero，具體步驟見：

對其他工具，也可以先做同樣的驗證：匯出一小批真實條目，確認接收工具能開啟資料、保留需要的資訊，再評估正式遷移。如果一篇稿件已經臨近提交，可以讓舊稿繼續使用舊工具，新專案先試新工具。

AI 能力怎麼比較：官方內建、第三方外掛與外部連線

文獻管理工具的 AI 功能主要覆蓋單篇閱讀、文獻庫問答、研究發現與整理。比較時應先確定需要處理的任務，再看模型、費用與來源核對方式。

工具或路線AI 功能試用時優先檢查
EndNote 2025官方 Research Assistant，文件問答、翻譯與摘要帳戶版本、使用權益、回答與原文的對應
MendeleyReading Assistant；其他能力按方案分檔免費體驗與目標功能對應的方案
JabRef可配置的論文摘要與對話模型提供方、PDF 解析和費用
Paperpile向外部 AI 助手傳送 PDF 的整合，官方公告標為 beta當前可用範圍、傳送內容和接收方帳戶
Citavi論文要點、段落摘要和論文檢索具體版本、許可及所需工作流
Zotero + BibGenie在 Zotero 中圍繞材料對話、發現研究、輔助整理模型設定、來源核對與寫入前確認

第三方工具資料：EndNote Research Assistant、Mendeley 方案、JabRef AI、Paperpile AI 整合公告、Citavi 產品頁。

如果你選定 Zotero，也希望增加 AI 研究工作流，可以試用我們開發的 BibGenie：在論文與筆記的上下文中提問，透過 OpenAlex 發現相關研究，並協助處理文獻庫整理。安裝步驟見 BibGenie 指南。BibGenie 安裝在 Zotero 中，使用已有文獻庫開展這些任務。

比較 AI 時，可以給候選工具同一篇你熟悉的論文，提出三個問題：

  1. 研究物件、方法和主要限制分別是什麼？
  2. 回答裡的關鍵判斷，可以在原文哪裡找到依據？
  3. 當資料不足時，工具會明確說明，還是繼續生成看似完整的回答？

同時記錄實際費用、等待時間、切換應用的次數和核對來源的便利程度，比較各工具完成同一任務的成本與效果。

試用驗收：用五個環節判斷是否適合長期使用

選出兩款候選工具後，用同一批文獻完成收集、閱讀、寫作、協作和匯出測試：

環節透過條件
收集從常用資料庫或期刊頁匯入記錄，重要欄位正確
閱讀PDF、批註和筆記的儲存位置清楚
寫作能插入、修改、刪除引用，重新開啟後仍可重新整理
協作合作者能繼續編輯，而不只是看到一張參考文獻表
退出能把需要保留的文獻和資料帶到別的環境

常見問題

下一步：用一組真實文獻，完成一次完整研究流程

先選擇與你最接近的兩款候選工具，放入同一批文獻，從收集一路做到寫作，再嘗試匯出與恢復。

如果你已經偏向 Zotero，可以繼續閱讀 Zotero 外掛推薦，根據下一步任務配置閱讀、翻譯、筆記和 AI。先把基礎流程用順，再增加功能，往往更容易形成能長期維護的研究環境。

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